Hola Juan,
calificando las tablas con el nombre de la base de datos:
USE bd1
GO
CREATE TABLE prueba
(a smallint)
GO
USE BD2
GO
INSERT bd1..prueba
SELECT 1
GO
UPDATE bd1..prueba
SET a = 2
GO
SELECT * FROM bd1..prueba
GO
-- si tenés que pasar información entre tablas:
CREATE TABLE prueba
(a smallint)
GO
INSERT bd2..prueba
SELECT 5
GO
UPDATE bd1..prueba
SET a = bd2..prueba.a
FROM bd2..prueba
GO
SELECT * bd1..prueba