prueba con los dde:
http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/techdoc/ref/index.html?/access/helpdesk/help/techdoc/ref/ddeadv.html&http://www.google.es/search?hl=es&client=firefox-a&rls=org.mozilla%3Aes-ES%3Aofficial&hs=RuB&q=ddeadv&btnG=B%C3%BAsqueda&meta=
Aunque requieren de cierto conocimiento previo de la programación interna del programa con el que vayas a comunicarte.