Saludos,
prueba con este sencillo ejemplo:
<script type="text/javascript">
function moz(lnk) {
if (navigator.appName.indexOf("Mozilla") != -1){window.location=lnk}
else{confirm("Para acceder utiliza Mozilla");return false}
}
function iex(lnk) {
if (navigator.appName.indexOf("Microsoft") != -1){window.location=lnk}
else{confirm("Para acceder utiliza IExplorer");return false}
}
</script>
<p><a href="pagina_iex1.htm" onclick="iex(this.href);return false">LINK IEXPLORER 1</a></p>
<p><a href="pagina_iex2.htm" onclick="iex(this.href);return false">LINK IEXPLORER 2</a></p>
<p><a href="pagina_moz1.htm" onclick="moz(this.href);return false">LINK MOZILLA 1</a></p>
<p><a href="pagina_moz2.htm" onclick="moz(this.href);return false">LINK MOZILLA 2</a></p>
Espero sea útil.