Lo que pasa es que Windows NT utiliza Netbios para buscar las maquinas, esto genera mucho Broadcast y lo hace lento, en cambio Windows 2000 utiliza DNS y mantiene tablas de ruteo para memorizar las ubicaciones de las maquinas que se accesan.
Si tienes un Windows 2000 como Controlador de dominio, y tienes un BDC de NT se podria poner algo lento, y ademas la base de datos de usuario no podria crecer a mas de 40 mb.
Si puedes hacer la migracion y dejar todo en windows 2000 seria bueno, si no puedes, entonces migra los PDC y los BDC los formateas para que no le quite velocidad.
En los clientes tienes que instalar clientes para DNS y para Active Directory y listo.
Espero ayudar
Salude
