32Bits es mas rapido que 16 Bits, diferencia basica, si haces aplciaciones para Windows 95 en adelante, tienes que usar el VB de 32 bits, de lo contrario tu aplicacion de 16 bits puede resultar inificiente, ya que el sistema operativo si estas en una plataforma de 32 bits, tiene que convertir esos 16 bits en 32 bits, desaprovechando tiempo el procesador.