Unix - C Y Unix

Hola, me gustaría saber si puedo usar comando de unix como cut o short para hacer un programa en C bajo unix. Se que con la instrucción system( ) se puede pero si necesito usar una vble en esa instrucción??Por ejemplo si tengo un fichero q pusiera
usuario:pass: etc...
y yo quisiera sacar el pass como se haría:

vble=system(grep $vble2 Fichero|cut -f2);

muxas gracias por su ayuda.