Software - Problema con aplicacion

Hola,
Tengo un ordenador que funciona perfectamente con todas las aplicaciones menos con una, que cuando esta pensando se cuelga, esa misma aplicacion en otro ordenador con las mismas caracteristicas p4 y 1gb de ram tarda unos 3 min en hacer un calculo con los mismos parametros que en el ordenador que no funciona, he formateado el ordenador por si era algun problema de windows, y continua igual, alguien me puede ayudar, gracias?

Tratastes de cambiar los bancos de memoria, para verificar que no esten con problemas