PHP - Conexion PHP a MySQL

Hola, estuve viendo la clasica clase para conectarse de php a mysql, donde estan las funciones de conectar, desconectar, el constructory una funcion para la consulta.

Pero me fije en githup algunos proyectos y ninguno usa dicha clase, cada uno lo hace diferente, alguien me puede decir porque, o cual es el mejor modo de conectarse a MySQL con php.

Gracias