PHP - Aplicación para el control de gestión

Necesito hacer una aplicación para el control de la gestión comercial.
Básicamente sería para controlar las ventas de los comerciales, comparar contra sus objetivos, calcular sus comisiones y sobre todo el momento de su abono.
Ahora lo hago en excel y mi problema principal es que hay ocasiones en las que se han producido errores y no se puede detectar fácilmente dónde o quién ha cometido el error. Entonces no tengo mas remedio que repasar abonos de meses anteriores hasta estar "seguro" de que algo se abona por completo y que no se ha abonado dos veces.
¿Alguien ha hecho algo similar y me podría orientar?.
Gracias de antemano.

uff tio espero que no tengas prisa porque eso es un verdadero proyecto ... suerte!!