Matlab - correr programa juno con simulacion

Hola amigos..... bueno mi pregunta es la siguiente estoy tratando de hacer una simulacion la cual obtiene datos desde el workspace y bueno estos datos llegan ahi por un programa que debo correr..... mi pregunta es si existe alguna forma de hacer que mi programa corra junto con la simulacion o simplemente que corra constantemente .
Cualquier ayuda sirve gracias.

Podrías poner los dos programas en un script, de esa manera corres un solo programa.

No esta muy clara tu pregunta.