Matlab - handles

Tengo una interface gráfica, en la cual las variables se están guardando dentro de una estructura handles, sin embargo algunos de los campos de la estructura se están reiniciando, es decir, no están almacenando las variables, creo que el problema está en los tipos como se guardan

guidata(handles.figure1,handles)

No sé si abra otra forma de guidata para guardar que me permita que las variables no se reinicien, o si conocen de alguna otra posible fuente de error

Seguramente ya lo tengas resuelto, pero por si acaso.

guidata(hObject, handles);%guarda estructura de handles