Linux - Intalar servidor Linux

Hola amigos, la verdad soy un novato en el mundo linux, estoy realizando una aplicacion cliente servidor y por cuestiones de costos he decido colocar un servidor Linux con los clientes en Win98. Mis interrogantes son los siguientes.
* Que version de Linux me recomiendan para instalarla en el servidor
* como instalo Linux
* Como hago la coneccion entre el servidor y los clientes (recuerden que estaran en windows)

Si alguno puede resolver mis interrogantes se los agradeceria en el alma...por favor si pueden sean bastante explicativos. Gracias

Hola.
Quiero aclararme ciertas dudas antes de contestarte a la pregunta.
Que tipo de aplicacion es?
Estas programando tu mismo el servidor o simplemente estas instalando un servidor ya hecho?
En caso de estar programando la aplicacion ,que lenguaje de programacion estas utilizando?
Si tienes clientes windows tambien podrias utilizar este SO para hacer la prueba con un servidor windows.

Agradeceria que explicases con mas detalle toda la problematica que tienes.

Un saludo