JavaScript - COMPARACION VALORES

Saludos,
Necesito comparar dos valores numericos en javascript, ambos son resultado de input, por ejemplo, 1000 contra 30000 me dice que 1000 es mayor que 30000, cosa que no es verdad y 1000 contra 500 si me saca el mensaje correcto.
Gracias.

Hola, lo que te puede pasar es que los tome como caracter y no como numerico, usa esta comparacion

if (Number(nombreform.nombreimput1.value) > Number(nombreform.nombreimput2.value))