Java - Comparacion

Hago el scanner y necesito saber como comparar si es cada texto contra otro texto
igual como lo comparo utilizo String.starsWith() pero no se como para cada in.next()compararlo con el primero al último menos contra el mismo...por favor respondan

No entiendo cual es tu problema, pero para comparar Strings puedes usar el método equals:
String s1 = '...' ;
String s2 = '...' ;
s1.equals(s2); // devolverá true or false

Y si quieres ordenar puedes usar compareTo(string1,string2)... suert!