Java - Comunicarme con un programa externo a Java

Hola gente!!! Mi duda es que estoy comunicándome con un programa externo de java (Pajek). Y me gustaría mandarle comandos directamente desde Java. ¿Es posible? La idea seria algo así, pero no me funciona :S

Process pajek = Runtime.getRuntime().exec("C:/pajek//pajek.exe " + datosParaPajek);
BufferedOutputStream bufferPajek = new BufferedOutputStream(pajek.getOutputStream());
bufferPajek.write(KeyEvent.VK_F10);

Si alguien pudiese ayudarme se lo agradecería. Un saludo a todos

Utiliza sockets, es la mejor opción.

Gracias, pero como le digo a un programa cualquiera (pajek en mi caso) que se conecte a un puerto?¿?¿?

Ya entiendo, no puedes modificar el programa.
Pues creo que no vas a poder, con Java.

La verdad es que ando en las mismas he tratado de comunicarme de la misma manera con Runtime en mi caso con el debuger de GDB pero no he podido si alguien tiene solucion se les agradeceria...