Java - Crear archivos

Tengo una aplicación a la cual le das 2 archivos a comparar, y escribe las lineas en un jTextArea.
La aplicación tiene un jButton para, si se quiere, guardar el contenido del jTextArea en un archivo, el problema está en que, al crear el nuevo archivo, no me respeta los saltos de linea, ¿cómo puedo hacerle para que los reconozca?
Lo que hago es más o menos así:

Stringbuffer cadena;
String cadena2;
cadena = new Stringbuffer();
...
cadena.append(cadena_a_agregar);
cadena.append("\n");
...
cadena2 = cadena.toString();
jTextArea1.setText(cadena2);
...
//si se quiere guardar en un archivo
java.io.FileWriter salida;
String areaTexto;
salida = new java.io.FileWriter(ruta);
areaTexto = jTextArea1.getText();
salida.write(areaTexto);
salida.close();

¿Estoy haciendo algo mal?
Gracias por su ayuda!

Hola:

No añadas un \n, sino un System.getProperty("line.separator")

cadena.append(cadena_a_agregar);
cadena.append(System.getProperty("line.separator"));

En http://www.chuidiang.com/java/novatos/editor/leer_escribir_fichero.php tienes un pequeño ejemplo.

Se bueno.

Muchísimas gracias, sirvió perfectamente!
Saludos!