Java - Incompatibilidad entre librerias

Hola! Estoy utilizando un .jar que ha creado otra persona y lo importo en mi codigo java. Yo utilizo la librerias del jaxb para manejar los ficheros xml, y en concreto, una de ellas que es jaxb-impl.jar. El problema es que el .jar que estoy utilizando de otra persona utiliza tambien esa libreria, pero debe ser otra version xq ocupa mas espacio en disco. La cuestion es que con mi libreria jaxb-impl me funciona mi parte pero no la de él, y al reves. Alguien sabe como lo puedo solucionar? Muchas gracias!!

Deben de estandarizar las versiones de jar ya que si no van a seguir teniendo esos problemas una excelente solución para manejar el build y el deploy de tus proyectos es usar Apache Maven:

http://maven.apache.org/