Java - Ocultar ficheros

Saludos compañeros, en mi aplicacion estoy tratando con ficheros xml, y con tipos de formato distinto, que se distingues en la cabecera del fichero xml (unos contienen datos numericos y otros ficheros cadenas, mas o menos, y se distinguen por la cabecera). Pues bien, lo que queria saber es si mi aplicacion al abrir el fichero con un objeto JFileChooser, tiene alguna manera de distinguir dichos ficheros y mostrar solo al usuario los ficheros que contienen cadenas, y los que contienen numeros que los mantenga en el disco duro, pero que no los muestre cuando el usuario pulse la opcion Abrir.

Espero que me haya explicado.
Gracias.