Java - Servicio Web Java

Tengo montado un Servicio Web Java con NetBeans y mi objetivo es hacer un scirpt(.class o .java) que haga una conexion con una Base de Datos.
Mi duda es en que carpeta dellas que se crea el servicio he de colocar este prohgramilla de conexion..gracias!!!!

Mi arbol de directorio es el siguiente:

SERVICIO WEB:
- build:
.Generated:wsBinary-wsClient-wsService
.Web:META-INF-WEB-INF-index.html-index.jsp
- nbproject
-test
-dist: webService.war
-src:
.- conf
.- java
-web:
.- index.html-index.jsp
.- WEB-INF/wsdl
- build.xml

El programa lo tengo colocado en la carpeta : src/java/conexionBD/cnxBD.java cnxBD.class