Java - Java componentes

Intento colorear dos paneles JPanel que están dentro de un panel JFrameContentPane mediante el método setBackground en el initialize de la clase pero no me los pinta, sólo pinta el JFrameContentPane unificando ese color a los otros dos paneles, de tal forma, que si cambio el color al panel principal los de dentro se quedan con el mismo color, mi finalidad es que los dos interiores tengan distinto color.

Hola:

Los JComponent (los JPanel entre ellos) son por defecto transparentes. Prueba a ponerles setOpaque(true) además de cambiar el color de background.

Se buena.