Java - el pan de cada dia, no entiendo porque no funciona

. Elabore un algoritmo que lea dos vectores. El primero, de M elementos, contendrá los códigos de los
estudiantes que perdieron Cálculo integral. El segundo, de N elementos, contiene los códigos de los
estudiantes que perdieron Lógica y algoritmos. Se debe crear e imprimir otro arreglo que contendrá los
códigos de los estudiantes que perdieron tanto Cálculo integral como Lógica y algoritmos.


package arreglos;

import javax.swing.JOptionPane;
public class ejercicio12 {
public static void main(String[] args) {
int a[],n, b[],m,c[],l=0;


do{
n=Integer.parseInt(JOptionPane.showInputDialog("digite el tamaño del vector a"));
m=Integer.parseInt(JOptionPane.showInputDialog("digite el tamaño del vector b"));

}while(n<0&&m<0);
a=new int[n]; b=new int[m];

for(int i=0;i<a.length;i++){
a[i]=Integer.parseInt(JOptionPane.showInputDialog("digite los codigos de los estudiantes que perdieron calculo de la posicion" + ""+i + ":"));

}

for(int j=0; j<b.length;j++){
b[j]=Integer.parseInt(JOptionPane.showInputDialog("digite los codigos de los estudiantes que perdieron logica de la posicion" + ""+j + ":"));
}

c=new int[n];
for(int i=0;i<a.length;i++){
for (int j=0; j<b.length;j++){
if(a[i]==b[i]){
l++;
c[l]=a[i] ;


}

}


}
if(l==0){
JOptionPane.showMessageDialog(null,"ningun estudiante perdio las dos materias");}
else{
JOptionPane.showMessageDialog(null,"los codigos de los estudiantes que perdieron las dos materias fueron ");
for(int i=0; i<l;i++)
JOptionPane.showMessageDialog(null, c[i]);}
}
}

Una cosita a mejorar.
Al pedir las longitudes de los vectores, tampoco debemos admitir el valor 0, así que las condiciones del while deberían ser "mientras n y m sean menor o igual que 0"



Luego, el principal error es que estás usando dos veces el índice i para comparar los elementos de los vectores.

Para el arreglo b, has de usar el índice j :

Con este pequeño cambio ya obtenemos mejores resultados, pero siguen siendo incorrectos.
Y es porque aún hay otro pequeño error, pero suficiente para que se fastidie todo.

Y es que estás incrementando la variable l ANTES de asignar el valor al arreglo c

Esto provoca que la posición [ 0 ] del vector quede siempre vacía, pero luego se mostrará en pantalla como si fuera un resultado correcto.
Para evitarlo, hay que hacer el incremento DESPUÉS de hacer la asignación:

Con esto parece que ya obtenemos los resultados deseados. Revísalo.
Un saludo.