Java - Que pasa con las direcciones

Bueno este es mi dilema, trabajo en un proyecto, un videojuego todo bien en base de java el cual hasta ahora funciona bien el problema es el siguiente:

estoy usando un motor que levanto a traves de Java con su Process p = new processbuilder y todo chevere la carpeta de dicho motor esta dentro de las carpetas del proyecto entonces si lo pongo asi

./carpetaProyecto/ejemplo

el corre fino iniciandolo desde el protocolo de comunicaciion, el problema viene cuando intento correr lo mismo pero desde el desckop launcher y me dice que no encuentra el archivo o que este no existe

java.io.IOException: Cannot run program "./mango/mangoPaola5": error=2, No existe el archivo o el directorio
at java.lang.ProcessBuilder.start(ProcessBuilder.java:1048)
at com.jayktec.comunicacion.Protocolo.start(Protocolo.java:71)
at com.jayktec.comunicacion.Conversacion.run(Conversacion.java:33)
Caused by: java.io.IOException: error=2, No existe el archivo o el directorio
at java.lang.UNIXProcess.forkAndExec(Native Method)
at java.lang.UNIXProcess.<init>(UNIXProcess.java:248)
at java.lang.ProcessImpl.start(ProcessImpl.java:134)
at java.lang.ProcessBuilder.start(ProcessBuilder.java:1029)
... 2 more

quisiera si pudieran decirme que creen ustedes que pasa aqui se los agradeceria mucho,

gracias de antemano cualquier solucion oposible solucion que me den cuidence