C/Visual C - Gobernar a otro software

Mis saludos nuevamente, necesito ayuda para realizar una aplicacion que me permita ordenar a otro software que ejecute un determinado numero de tareas que el software no puede realizar automaticamente (Flashcut2.exe) es un software CAM que trabaja con una fresadora y no puede realizar trabajos en serie, la maquina ejecuta su trabajo un sola vez mediante un plano que lee las cordenadas y una vez terminado el trabajo se tiene que resetar para volver a reaizar el mismo trabajo, y esto se necesita automatizar para hacer el trabajo cuantas veces se desee sin necesidad de resetear y volver a empezar de nuevo, agradecere mucho la ayuda que me puedan dar gracias de antemano.

Ponete en contacto conmigo a ver si te puedo ayudar en algo
Saludos desde Baires, JuanC