C/Visual C - Algo raro

Hola, hice un program que codifica y decodifca archivos de texto (es una tarea para la Universidad), y todo marcha bien en el programa que codifica, pero en el decodifica al principio del archivo de salida me tira una linea en blanco aun cuando en el archivo original no hay linea alguna al principio del archivo.

Pues sería difícil decirte cómo sin el código. Si quieres, escríbeme y envíame el código, y así te podré ayudar mejor.

De entrada te comento (porque luego suele pasar) que revises si no tienes basura en tu búfer (bytes no inicializados).