lubuntu, linux
Publicado por Juan Cruz (1 intervención) el 27/04/2017 02:13:55
Buenas informáticos. Tengo una base de datos de letras (que vendrían a ser aminoácidos) y quiero buscar patrones desde la terminal (trabajo en Linux, Lubuntu).
Lo que me interesa es buscar una repetición de ciertos aminoácidos que se repitan en una secuencia menor a 100 AA.
Escribí la siguiente línea pero no se cómo hacer para agregarle la restricción de que el match sea en una linea menor a 100 caracteres,
grep -nE F..F.{6} *
Alguna idea?
Mil gracias!!
Lo que me interesa es buscar una repetición de ciertos aminoácidos que se repitan en una secuencia menor a 100 AA.
Escribí la siguiente línea pero no se cómo hacer para agregarle la restricción de que el match sea en una linea menor a 100 caracteres,
grep -nE F..F.{6} *
Alguna idea?
Mil gracias!!
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