Bases de Datos - copis de respaldo en MySQL como se hace?

Hola, estoy desarrollando una aplicacion Cliente- Servidor en java y necesito hacer un backup (copia de respaldo) de la base de datos. Estoy trabajando con MySql y no se ademas si almacenarlo en un archivo .sql o de otra manera.
si alguien me pudiera dar una orientacio se los agradezco.