BIOS - first master y first slave se cambian a auto

Hola, tengo un ordenador con 2 discos duros, uno con windows 98, que no puedo formatear pq tengo un programa de contabilidad importante y otro con windows xp, que es quien hace de maestro. Cuando llevo tiempo sin encender el ordenador, me sale un mensaje que me dice "tabla de partición no valida" y entonces entro a la bios y veo que se ha cambiado el arranque o que se ha cambiado first master y first slave a auto, cuando yo antes habia dejado indicado quien es el maestro y el esclavo, si a continuación reinicio funciona, pero si lo dejo horas apagado me vuelve a pasar. Ya no sé que hacer y necesito muchisimo el ordenador. Si alguien sabe algo...
Un saludo y muchas gracias.