Lo puedes ver en Herramientas Administrativas->Diagnosis de Windows NT. Ahí seleccionas 'Controladores' y luego 'Unidades por letra' y vas seleccionando partición a partición y dándole a propiedades.
Ahí verás los bytes por sector de cada partición. Si ves 64KB es que lo tienes así, si ves 512 (valor por defecto) tendrás que reformatearlas (supongo que lo querrás para SQL Server).
Saludos,
Javi.